Landelijke samenwerking: Unie-ABC
De Baptistengemeente Lelystad is aangesloten bij de Unie-ABC. Unie-ABC is een samenwerking van baptistengemeenten en CAMA-gemeenten in Nederland. Unie-ABC is ontstaan uit een fusie van de Unie van Baptistengemeenten in Nederland en de Alliantie van Baptisten- en CAMA-gemeenten.
Samenwerking Lelystadse kerken
In Lelystad wordt samengewerkt met andere kerken in het Platform Lelystadse Kerken (PLEK).
Hulpverlening
De gemeente is betrokken bij het werk van het IDO. Het IDO is ontstaan vanuit de Lelystadse kerken en heeft als motto Helpen waar geen helper is. In de twee inloophuizen van het IDO is iedereen welkom en kan daar ook om hulp vragen (voedselbank, schuldhulpverlening, noodhulp …). Ook kan het IDO doorverwijzen naar andere instanties die hulp kunnen bieden.